Mais Bioinformática Para Linux
Genepidgin é um conjunto de ferramentas que auxiliam no Python nomes de produtos de avaliação e atribuição de genes & nbsp; Há três componentes primários.:genepidgin * limpador *& Nbsp; padroniza nomes de genes por diretrizes de nomenclatura...
PASSOS é um pacote para simulação estocástica exata de sistemas de reação-difusão em geometrias 3D complexas e arbitrárias. O nosso algoritmo de simulação de núcleo é uma implementação de SSA de Gillespie, estendido para lidar com a difusão de moléculas...
TRMiner é um utilitário Python que visa curadores de dados científicos. & Nbsp; Ele permite podar rapidamente grandes coleções de publicações científicas a sentenças relevantes para uma determinada meta de mineração.Isto é conseguido em dois passos. Em...
O Sistema de Referência Bioinformática é uma tentativa de construir uma estrutura razoável de testes, testes, e os dados, para permitir que os usuários finais e fornecedores para sondar o desempenho de seus sistemas.O que estamos tentando fazer é criar um...
Staden Package é um conjunto plenamente desenvolvido de montagem sequência de ADN (Gap4), edição e ferramentas de análise (rotação) para Unix, Linux, MacOSX e MS Windows.Na frente de Gap4 houve várias menor juntar relacionadomelhorias na forma como ela se...
AREM é um baseado em MACS (análise com base Modelo de dados do chip-Seq).Sequenciação de elevado rendimento acoplado a cromatina imuno- precipitação (ChIP-SEQ) é amplamente utilizado na caracterização a nível genoma padrões de ligação de factores de...
seriesoftubes é um gasoduto estendida para Solexa dados do chip-seq.Pacote de Documentação
Requisitos :
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MetagenomeDB é uma biblioteca Python projetado para armazenar com facilidade, recuperar e anotar sequências metagenomic. & Nbsp; MetagenomeDB agir como uma camada de abstração em cima de um banco de dados MongoDB. Ele fornece uma API para criar e...
Seal é um módulo Python que fornece alinhamento de sequências em Hadoop.Seal é uma aplicação de MapReduce para o alinhamento de seqüências biológicas. Ele roda em Hadoop (http://hadoop.apache.org) através Pydoop (http://pydoop.sourceforge.net), uma API...
MISO (mistura das isoformas) é uma estrutura probabilística escrita em Python que quantifica o nível de expressão & nbsp; de genes provenientes de splicing alternativo de dados de RNA-Seq, e identifica isoformas reguladas diferencialmente ou exões entre...
