Mais Bioinformática Para Linux

Construir sistemas como o make são freqüentemente usados ​​para criar fluxos de trabalho complexos, por exemplo, em bioinformática. & nbsp; snakemake visa reduzir a complexidade da criação de fluxos de trabalho, fornecendo uma linguagem limpa e moderna de...

CLC DNA Workbench cria um ambiente de software permitindo usuários de fazer um grande número de seqüência avançada análises de DNA, combinada com gerenciamento de dados lisa, e excelentes opções de visualização e saída de gráficos.CLC DNA Workbench está...

seriesoftubes é um gasoduto estendida para Solexa dados do chip-seq.Pacote de Documentação Requisitos : ...

O projeto STEME começou a vida como uma aproximação com o algoritmo Expectation-Maximização para o tipo de modelo utilizado na localizadores motivo, como meme.STEME & rsquo; s EM aproximação executa uma ordem de magnitude mais rapidamente do que a...

Genepidgin é um conjunto de ferramentas que auxiliam no Python nomes de produtos de avaliação e atribuição de genes & nbsp; Há três componentes primários.:genepidgin * limpador *& Nbsp; padroniza nomes de genes por diretrizes de nomenclatura...

MISO (mistura das isoformas) é uma estrutura probabilística escrita em Python que quantifica o nível de expressão & nbsp; de genes provenientes de splicing alternativo de dados de RNA-Seq, e identifica isoformas reguladas diferencialmente ou exões entre...

Pathomx (anteriormente MetaPath) é um software gráfico open source implementado em IPython, Qt e PyQt, projetado a partir do zero para funcionar como um utilitário interativo para a visualização e análise de dados metabólicos sob GNU / Linux e outros...

Burrows-Wheeler alinhador (BWA) é um programa eficiente, que alinha sequências de nucleótidos relativamente curtas contra uma sequência de referência de tempo, tal como o genoma humano.O software implementa dois algoritmos, BWA de curto e BWA-SW. Os...

avalanchetoolbox é uma caixa de ferramentas para identificar e descrever os processos de ramificação, como avalanches neuronais Requisitos :. ...

OpenElectrophy é um quadro para facilitar a manipulação, armazenamento e análise de dados eletrofisiológicos. É possível importar dados de diversos formatos de arquivo e armazená-los em um único banco de dados do tipo SQL.As ferramentas de análise...