PathVisio é uma fonte aberta e aplicação gráfica completamente livre implementado na linguagem de programação Java e projetada desde o início para ser usado para exibir, analisar e editar caminhos biológicos sob um operacional GNU / Linux system.Can ser usado para desenhar caminhos , vincular software entitiesThe biológica permite aos usuários desenhar caminhos, vincule entidades biológicas (proteínas ou genes) para dados biológicos, usando identificadores de banco de dados, editar caminhos, bem como para analisar caminhos. Com PathVisio você também será capaz de mapear dados experimentais, tais como dados de microarranjos, e visualizá-lo em cima do desenho via existente.
Além disso, você será capaz de selecionar um banco de dados gene, selecione um banco de dados metabólica, ver as estatísticas, dados de expressão Importar, selecione conjunto de dados de expressão, caminhos de busca, visualização de legenda, manipular objetos, projetos de importação, bem como para instalar e gerenciar plugins, que pode adicionar funcionalidade adicional para os app.Requires nenhuma aplicação installationThe podem ser usados sem instalá-lo em seu sistema operacional GNU / Linux. Tudo que você tem a fazer é baixar o pacote binário de Softoware, salve o arquivo em um local de sua escolha, extraí-lo usando um utilitário gerenciador de arquivos, abra o diretório extraído, e clique duas vezes no pathvisio.jar file.Under o hoodWhile dando uma olhada rápida sob o capô do software PathVisio, nós & rsquo; tenho notado que a aplicação é inteiramente escrito na linguagem de programação Java, e que a sua interface gráfica do usuário é projetado com as mais recentes tecnologias Java Swing. We & rsquo; ve testado com sucesso o aplicativo em computadores que suportam um dos architectures.Runs CPU 32 ou 64 bits em qualquer sistema operacional onde o Java está supportedBeing escritos na linguagem de programação Java, PathVisio pode ser declarado um aplicativo independente de plataforma que suporta GNU / Linux , Microsoft Windows, Mac OS X, BSD, Solaris, e qualquer outro sistema operacional, onde as últimas tecnologias Java são suportados
O que é novo nesta versão:.
- 31 de janeiro de 2014: Bug corrigir lançamento
- termos GeneOntology agora são removidos a partir dos resultados da pesquisa para anotações
- DataNodes precisa ser anotado com ID e Datasource ou nada (economia de nós de dados com apenas ID ou fonte de dados não é mais permitido)
O que é novo na versão 3.1.2:
- Major bug no módulo de importação de arquivo fixo: http: //developers.pathvisio.org/ticket/1697
O que é novo na versão 2.0.11:
- Gravação automática
- Zoom usando roda de rolagem
- Seleção de linhas é mais fácil: já não é necessário clicar sobre o pixel exato
- Agora, com dois métodos para análise de sobre-representação; orientada para o caminho e uma orientada a dados
O que é novo na versão 2.0.10:
- nova forma de desenhar retângulos arredondados para evitar efeito do alongamento
- Várias pequenas correções de bugs
O que é novo na versão 2.0.9:
- New tipo de conector para o conector de comprimento arbitrário e arbitrária ângulos
- New & quot; componente celular & quot; propriedade para armazenar o significado biológico de um compartimento
- New & quot; dupla & quot; tipo de linha (especialmente útil para organelas dupla membranados)
- hyperlinks clicáveis nas vias
- ver marco: & quot; milestone_27 & quot; Para obter uma lista completa de correções de bugs
O que é novo na versão 2.0.8:
- formas melhoradas para componentes celulares
- Algumas melhorias de usabilidade, como copiar / colar no menu pop-up
- ver marco: & quot; milestone_26 & quot; Para obter uma lista completa de correções de bugs
O que é novo na versão 2.0.7:
- ícones da barra de ferramentas e novo painel de lado para tornar mais fácil para selecionar os tipos e formas de seta (graças liubing)
- bancos de dados via são incluídos como fonte de dados, de modo que você pode adicionar links a partir de uma via para outra
- BioPAX conversor foi melhorado e produz documentos BioPAX mais válidos.
- novo tipo de conector, onde cada ponto podem ser manipulados (graças leonth)
- Número de fontes de dados foi aumentado para mais de 180
- ver marco: & quot; milestone_25 & quot; Para obter uma lista completa de correções de bugs
O que é novo na versão 2.0.6:
- O número de âncoras em uma forma pode ser aumentada a partir do padrão 12.
- A lenda da visualização de dados podem agora ser mostrado a imagem via-se diante. Anteriormente, só era visível em um painel lateral.
- ver marco: & quot; milestone_24 & quot; Para obter uma lista completa de correções de bugs
O que é novo na versão 2.0.4:
- melhorou a formatação do texto de formas, rótulos e DataNodes
- muitas outras formas para DataNodes
- coordenadas de pixel simples
- definir a cor de fundo sobre DataNodes
O que é novo na versão 2.0.3:
- O mais notável nesta versão é o novo Schema XML para o formato via GPML (versão 2010a). Este novo formato via permitirá muitas novas capacidades gráficas do futuro, você pode olhar para a frente a algumas das pessoas que aparecem na próxima versão.
- Outros novos recursos:
- âncoras Invisíveis são realmente invisível, pelo menos quando algo está ligado a eles (Graças a Margot)
- opção extra -v (graças a Mark)
- banco de dados atualmente selecionado é exibido corretamente na barra de status novamente
- Muitos novos pontos de extensão para desenvolvedores de plugins
- ver marco: & quot; milestone_21 & quot; Para obter uma lista completa de correções de bugs
O que é novo na versão 2.0.1:
- algoritmo melhorado para conectores automáticos que apontam para uma âncora .
- Melhoria desenho de tipos de setas que têm um curto & quot; gap & quot; no final.
- Como o serviço thawte freemail foi cancelada, atualizamos nosso certificado de segurança
- O espectador Pathway História tinha um bug onde cada linha foi considerada modificada, mesmo que isso não era. Isso foi corrigido.
Requisitos :
- A Oracle Java Standard Edition Runtime Environment
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