Livre Bioinformática Para Linux
Seal é um módulo Python que fornece alinhamento de sequências em Hadoop.Seal é uma aplicação de MapReduce para o alinhamento de seqüências biológicas. Ele roda em Hadoop (http://hadoop.apache.org) através Pydoop (http://pydoop.sourceforge.net), uma API...
TRMiner é um utilitário Python que visa curadores de dados científicos. & Nbsp; Ele permite podar rapidamente grandes coleções de publicações científicas a sentenças relevantes para uma determinada meta de mineração.Isto é conseguido em dois passos. Em...
Pysam é um módulo Python para leitura e manipulação Samfiles & nbsp;. É um invólucro leve do samtools C-API.O guia rápido é aqui. Documentação mais detalhada está disponível aqui.Perguntas e comentários são muito bem-vinda e deve ser enviada para o grupo...
PySCeS é um projeto desenvolvido pela Triple-J Grupo de Molecular Cell Physiology & nbsp;., A fim de tentar modelo e compreender os processos e sistemas complexos que compõem a célula viva Características :. A linguagem de descrição de modelo...
goby é uma API Python para a leitura de arquivos de dados binários criada usando o framework de gerenciamento de dados Goby next-gen.Normalmente, esse diretório vem como parte do pacote de Goby completo, disponível em:& Nbsp; http:...
SSuMMo é uma biblioteca de funções projetadas em torno de forma iterativa usando hmmer atribuir sequências de taxa. & Nbsp; Os resultados são altamente árvores anotados mostrando espécies / distribuição do gênero dentro dessa comunidade.Programas...
Burrows-Wheeler alinhador (BWA) é um programa eficiente, que alinha sequências de nucleótidos relativamente curtas contra uma sequência de referência de tempo, tal como o genoma humano.O software implementa dois algoritmos, BWA de curto e BWA-SW. Os...
A turfa é um conjunto de programas para capturar, previsão e análise das características biofísicas de proteínas.Veja http://enzyme.ucd.ie/PEAT para documentação, instruções, screenshots etc Requisitos :. ...
OpenElectrophy é um quadro para facilitar a manipulação, armazenamento e análise de dados eletrofisiológicos. É possível importar dados de diversos formatos de arquivo e armazená-los em um único banco de dados do tipo SQL.As ferramentas de análise...
NEO (Ensemble Neural Objects) e é um projeto para fornecer um conjunto comum de classes de base a ser utilizado na análise de dados neural, com o objectivo de obter OpenElectrophy, NeuroTools e talvez outros projetos com objetivos semelhantes mais...
