MACS2

MACS2 é uma ferramenta de análise de modelo baseado em dados do chip-Seq.
Com o aprimoramento das técnicas de sequenciamento, cromatina imunoprecipitação seguido de alta taxa de transferência de seqüenciamento (CHIP-Seq) está ficando popular para estudar as interações proteína-ADN do genoma. Para suprir a falta de poderoso método de análise ChIP-Seq, apresentamos um novo algoritmo, chamado Análise baseada em modelo de ChIP-Seq (MACS), para a identificação de fator de transcrição locais de ligação. MACS capta a influência da complexidade do genoma para avaliar a significância das regiões ChIP enriquecidas, e MACS melhora a resolução espacial dos locais de ligação através da combinação das informações de ambos posição tag seqüenciamento e orientação. . MACS pode ser facilmente utilizado para dados do chip-Seq sozinho, ou com amostra de controlo com o aumento da especificidade

Requisitos :

• Python