CWC Simulator

CWC Simulator é um C ++ aplicação da CWC, um cálculo para a representação e simulação de sistemas biológicos. & Nbsp; Depois de uma instalação bem-sucedida (veja INSTALAR) você vai ser capaz de executar simulações sobre os modelos CWC, como demonstrado em alguns exemplos (ver exemplos /).
(linha de comando) de Interface
Como usuário genérico, você deve executar:

model.cwc -i
-o
-t
-s
-n
-c
--qt-limite
-q
-w <> trabalhadores
Onde:
- é o nome do executável (padrão: SCWC);
& Nbsp; - model.cwc é o programa CWC entrada (ver exemplos);
& Nbsp; - estatísticas é o prefixo de saída-arquivos;
& Nbsp; - é o limite de tempo de simulação;
& Nbsp; - é o período de amostragem (ou seja, 0,12 para obter 250 pontos com o tempo-limite = 30);
& Nbsp; - é o número de casos de simulação;
& Nbsp; - é o número de clusters para k-médias
& Nbsp; - é o limite para QT agrupamento
& Nbsp; - é o número de quantis;
& Nbsp; - tem normalmente para coincidir com o número de núcleos de seu sistema (ou seja, 4 por CPU quad-core).
Saída
A ferramenta produz:
- Alguns arquivos .dat (a saída amostrada das simulações)
- Alguns scripts gnuplot para desenhar analysises estatísticos
Estamos trabalhando em um manual do usuário abrangente

Recursos :.

• Gillespie SSA algoritmo em relação aos modelos CWC
• híbrido estocástico / semântica determinísticos
• Várias instâncias de simulação com estatísticas on-line
• Otimização para arquiteturas multicore baseado em quadro FastFlow
• quadro estatístico (Extensible média-variância, filtrada agrupamento etc).
• Várias semântica de rating (ação de massa, Michaelis-Menten, Encosta etc).