Visualizando proteína-proteína e ligando-proteína interações como gráficos (redes), onde biomoléculas são representados como nós e suas interações são representados como links, é uma abordagem promissora para a integração de resultados experimentais de diferentes fontes para alcançar a compreensão sistemática dos mecanismos moleculares condução fenótipo celular. O surgimento de redes de sinalização de grande escala fornece uma oportunidade para a análise estatística topológico, enquanto a visualização de tais redes representa um desafio. SAVI implementa métodos padrão para calcular a aglomeração, a distribuição de conectividade e detecção, assim como a visualização, de motivos de rede. Além disso, SAVI gera um site completo de conjuntos de dados de rede em formato de texto. SAVI contém uma ferramenta chamada PathwayGenerator. Esta ferramenta cria mapas de conexão como páginas Web de grandes tabelas que descrevem interações de sinalização celular. SAVI também pode criar redes de listas de nomes gene / proteína
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