SimSoup

SimSoup é um simulador de Química Artificial gráfica para Linux e Windows.
O programa permite a Química para ser definido em termos de tipos de molécula e as possíveis interações entre eles. Uma execução de simulação envolve a criação de um número de moléculas de vários tipos Molécula num reactor, e, em seguida, permitindo interacções tomar lugar ao longo de um período de tempo. Interações que ocorrem no reator são mostradas em um display gráfico.
A motivação para o desenvolvimento do programa é permitir que as investigações sobre o comportamento das redes, particularmente em relação à 'metabolismo de primeira' teorias da origem da vida, embora o projeto básico do SimSoup suporta modelagem de qualquer rede em que interações podem ocorrer entre nodos.
Atualmente, o desenvolvimento SimSoup chegou a fase de protótipo.
Aqui estão algumas características-chave de "SimSoup":
ย ท A Química: incluindo tipos de molécula e tipos de interação
ย ท um reactor: nas quais as interacções têm lugar entre as moléculas dos vários tipos
ย ท gráficas Vistas da Química e do Estado Reator
ย ท Representação Gráfica de Simulação Estatística incluindo: -
- Lotes Série Time: Estes mostram o comportamento de séries temporais de uma série de variáveis ​​que são monitorados enquanto a simulação roda
- Manhattan do lote: Isto mostra a variabilidade da composição do material no reactor ao longo do tempo
ย ท Trackers e Detecção de Ciclo (NOVO): Estes permitem ciclos de ser detectada e monitorada
ย ท Conservação de Massa
ย ท Calor e Termodinâmica (NOVO): as taxas de reação são baseadas em considerações de energia e termodinâmica
ย ท Visualização Cenário: A exibição do cenário e status informações atuais sobre o seu progresso
ย ท Solicitações de Ação (Nova): Estes são eventos que podem ser programadas para ocorrer em horários específicos. Por exemplo, um Pedido de acção pode ser configurado para fazer com que uma molécula de um tipo especial de ser adicionado ao reactor
ย ท processador de entrada (NOVO): Isto permite que um cenário de simulação a ser definida em um arquivo e ser carregada para SimSoup
ย ท Monitor do sistema: A (parcialmente escondido) ecrã - principalmente para fins de diagnóstico
ย ท Interface melhorado usuário baseado totalmente em GTK (NOVO)
Requisitos:
ย ท GSL (GNU Scientific Library)
ย ท Gtkmm (A C ++ interface para a biblioteca GTK + GUI)
O que há de novo nesta versão:
ย ท Trackers e Detecção Ciclo: Estes permitem ciclos de ser detectada e monitorada
ย ท Calor e Termodinâmica: as taxas de reação são baseadas em considerações de energia e termodinâmica
ย ท Solicitações de Ação: Estes são eventos que podem ser programadas para ocorrer em horários específicos. Por exemplo, um Pedido de acção pode ser configurado para fazer com que uma molécula de um tipo especial de ser adicionado ao reactor
ย ท processador de entrada: Isso permite que um cenário de simulação a ser definida em um arquivo e ser carregada para SimSoup
ย ท Interface melhorado usuário baseado totalmente em GTK.