projeto Sigint é uma ferramenta de software de linha de comando que pode ser usado para encontrar e classificar proteínas de mamíferos / genes que interagem especificamente e significativamente com uma lista de proteínas / genes no contexto de um fundo signalome mamíferos e redes interactome.
As entradas para o programa são: (a) uma lista de símbolos semente genes Entrez Gene humanos, (b) a redes de fundo em formato SIG, e (c) um nome para o arquivo de saída (nome do arquivo página da web com a extensão htm ). Sigint resulta em uma lista ordenada de genes / proteínas que interage com os componentes da lista de semente. Estes componentes são classificados por um z-score que mede a especificidade destes componentes intermédios para interagir com os genes / proteínas a partir da lista de sementes.
Sigint pode ser executado em sistemas operacionais Linux, Mac e Windows e requer um arquivo de texto em formato de rede fundo SIG.
Uso:
Extraia o arquivo
chmod + x sigint_lnx.exe
./sigint_lnx.exe
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