Gabedit

Gabedit é uma interface gráfica do usuário para Gaussian, Molcas, Molpro e MPQC pacotes de química computacional.
 
 Gabedit inclui instalações gráficas para gerar palavras-chave e opções, especificações moléculas e utras seções de entrada para até mesmo os tipos de cálculo mais avançados Gabedit inclui um construtor Molecule avançada.
 
 Você pode usá-lo para esboçar rapidamente em moléculas e examiná-los em três dimensões. Você pode construir moléculas por átomo, anel, grupo, aminoácidos e nucleosídeo. Você também pode ler geometria a partir de um arquivo. A maioria dos principais formatos de arquivo molecular são suportados.
 
 Gabedit inclui uma janela de configuração Cálculo Gaussian, Molcas, Molpro e MPQC que lhe permite configurar trabalhos de Gauss, Molcas, Molpro e MPQC de uma forma simples e direta.
 
 Gabedit inclui um editor de texto para editar Molcas, Molpro, arquivos de entrada de Gauss e MPQC.
 
 Gabedit pode exibir graficamente uma variedade de Gaussian, Molcas, Molpro, MPQC e resultados (parcialmente) de cálculo ADF, incluindo o seguinte:
 
 ย ท orbitais moleculares.
 ย ท Superfícies a partir da densidade de elétrons, potencial eletrostático, blindagem RMN densidade e outras propriedades.
 ย ท superfícies podem ser exibidos nos modos de malha sólida, translúcidos e arame.
 ย ท superfícies podem ser colorido por uma propriedade separada.
 ย ท Contours (codificado por cores).
 ย ท Planes (codificado por cores).
 ย ท dipolo
 ย ท eixos XYZ e os eixos principais da molécula.
 ย ท Animação dos modos normais correspondem a freqüências vibratórias.
 ย ท Animação da rotação da geometria, a superfície, dipolo, XYZ e os eixos principais da molécula.
 ย ท Animação de contornos.
 ย ท Animação de aviões codificado por cores.
 
 Gabedit pode exibir IV e Raman Os espectros de calculado. Gabedit pode gerar um arquivo povray para geometria (átomos + títulos, incluindo ligação de hidrogênio), superfícies (incluindo as codificado por cores), contornos, aviões codificado por cores.
 
 Gabedit pode salvar imagem em PPM, BMP, (JPEG) e formato PS. Gabedit pode gerar automaticamente uma série de imagens para a animação (vibração, a convergência geometria, rotação, contornos, aviões codificado por cores)

O que é novo nesta versão:

• Pequenos bugs foram corrigidos.
• NWChem é agora suportado.
• Os jogos nativos do Windows é agora suportado.

O que é novo na versão 2.3.5:.

• pequenos bugs foram corrigidos
• Os átomos podem ser corrigidos durante uma simulação de dinâmica molecular.
• A migração do Cairo para OpenGL para desenhar a janela de geometria.
• A migração do gtkglarea para GtkGLExt.
• Paralelização usando OpenMP.

O que é novo na versão 2.3.0:.

• pequenos bugs foram corrigidos
• O usuário pode ler os orbitais, geometria e modos normais de um arquivo Gaussian fchk.
• Pode-se ler os orbitais do novo formato de arquivo aux mopac (incluindo o formato comprimido).
• Várias novas opções em XYPlot e ContoursPlot janelas (Inserir texto, linha, seta, imagens, novos temas ...).
• Os comprimentos de ligação pode ser corrigido durante uma simulação MD.
• otimização parcial é agora possível com o potencial MM.
• A implementação de uma ferramenta para prever as massas e as abundâncias dos isótopos para uma determinada molécula. Implementação de uma ferramenta para calcular as suscetibilidades eletrofílicos, nucleofílicas e radicais para uma molécula.

O que é novo na versão 2.2.0:

• pequenos bugs foram corrigidos
• Todas as alterações geométricas pode ser desfeito e refeito usando o Desfazer e Refazer (u / L ou Ctrl z / Ctrl y)
• O usuário tem controle completo sobre os títulos exibidos em um desenho.
• O desenho da molécula átomo por átomo foram simplificados.
• O desenho do fragmento por fragmento de molécula foram simplificadas.
• Gabedit ler conectividades de Gabedit, him, PDB, mol2 e arquivos mol.
• O usuário pode definir o valor da distância, ângulo de ligação e ângulo diedro.
• A dinâmica molecular pesquisa conformacional é implementado utilizando um potencial MM (âmbar 99).
• A dinâmica molecular pesquisa conformacional é implementado utilizando um método semi-empírico (a partir de Abrir Mopac ou PCGamess).
• A migração das funções de desenho GDK para Cairo:. Cross-dispositivo de processamento de gráficos vetoriais
• O Cairo é usado agora para o widget XYplot Gabedit (usado por Gabedit de frequências empate).
• O Cairo é usado agora para a janela de desenho da geometria.
• Geometry podem ser exportados em EPS, PS, PDF ou arquivos SVG.
• As curvas de janela XYplot podem ser exportados em EPS, PS, PDF ou arquivos SVG.
• Nova ferramenta para a distância de computação entre 2 pontos no indicador XYPlot. & Quot; Control + botão shift & quot; pode ser usado para fazer um zoom na janela XYPlot.
• A nova versão do PCGamess (vaga-lume) agora é suportado

O que é novo na versão 2.1.13:

• Pequenos bugs foram fixe
• A dinâmica molecular pesquisa conformacional é implementado utilizando um potencial MM (âmbar 99).
• A dinâmica molecular pesquisa conformacional é implementado utilizando um potencial semi-empírico (usando MOPAC ou PCGAMESS).
• Pode-se otimizar a geometria de forma interativa usando MOPAC ou PCGamess semi-empírico método, a partir da janela Geometria do Draw
• A migração das funções de desenho GDK para Cairo: Cross-dispositivo de processamento de gráficos vetoriais. Cairo é usado agora para o widget XYplot Gabedit (usado por Gabedit de frequências empate). Cairo é usado agora para a janela de desenho da geometria.
• Geometry podem ser exportados em EPS, PS, PDF ou arquivos SVG. As curvas de janela XYplot podem ser exportados em EPS, PS, PDF ou arquivos SVG.
• Nova ferramenta para a distância de computação entre 2 pontos no indicador XYPlot. & Quot; Control + botão esquerdo do & quot; pode ser usado para fazer um zoom na janela XYPlot.
• A nova versão do PC Gamess / Firefly agora é suportado

Requisitos :

• GTK +