GENESIS (abreviação de simulação do sistema neural geral) é uma plataforma de simulação de propósito geral, que foi desenvolvido para apoiar a simulação de sistemas neurais que vão desde componentes subcelulares e reações bioquímicas para modelos complexos de neurônios individuais, simulações de grandes redes, e Systems- modelos de nível.
GENESIS forneceu a base para cursos de laboratório em simulação neural no Caltech, o Laboratório de Biologia Marinha, o Crete, Trieste, Bangalore, e Óbidos cursos de curta duração em Neurociência Computacional, e pelo menos 49 universidades dos quais temos conhecimento.
A maioria dos aplicativos GENESIS atuais envolvem simulações realistas de sistemas neurais biológicos. Embora o software também pode modelar redes mais abstratos, outros simuladores são mais adequados para backpropagation e modelagem conexionista similar.
Instalação
1. Escolha o local onde deseja instalar a "gênese" árvore de diretórios. Se você estiver fazendo uma instalação de todo o sistema como usuário "root", / usr / local é uma boa escolha. Para uma instalação pessoal, sem privilégios de root, você pode usar seu diretório home ("~"). Mude para esse diretório e extraia o diretório gênese do arquivo genesis2.2.1-linux-bin.tar.gz. Por exemplo,
cd / usr / local
tar xvzf /mnt/cdrom/genesis2.2.1-linux-bin.tar.gz
ou de onde você tê-lo (por exemplo ~ / Downloads / genesis2.2.1-linux-bin.tar.gz).
2. Mude para o diretório "génese" e executar o script de instalação que cria o ".simrc" arquivo de inicialização GENESIS ". Em seguida, copie .simrc para seu diretório home.
cd gênese
./binsetup
cp .simrc ~
3. Finallly, adicionar o diretório gênese no seu caminho de pesquisa, de modo que "gênese" podem ser encontrados a partir de qualquer diretório que você está dentro. Se seu shell de login é bash, você pode fazer isso editando o arquivo .bashrc em seu diretório home para adicionar a linha
PATH = $ PATH: / usr / local / genesis
no final do ficheiro. Se você estiver usando tcsh ou csh como seu shell de comando, adicione
Definir caminho = ($ caminho / usr / local / génese)
no seu .tcsh ou arquivo .csh.
Neste ponto, você está pronto para tentar executar GENESIS. Mude para o diretório Genesis / Scripts e experimentar alguns dos tutoriais sugeridas no arquivo LEIA-ME
O que é novo nesta versão:.
- Várias correções de bugs e melhorias.
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