Arabidopsis Motif Scanner (AMS) é um aplicativo do Windows que roda em computadores locais. Ele foi desenvolvido para construir redes de genes, identificando as posições dos elementos cis-regulação na planta modelo Arabidopsis thaliana e fornecendo uma interface fácil de analisar e avaliar as relações genéticas. Sua principal característica inovadora é combinar as posições de elementos cis-regulatórias, dados de expressão NGS e de DNA Chip Arrays, anotações de Arabidopsis e interações gene para a identificação de redes de genes regulados por fatores de transcrição. Em estudos focados em função de fatores de transcrição, o software usa os dados de expressão e vinculativo motivos do site nas regiões de genes reguladores de prever genes alvos diretos. Além disso, o AMS utiliza dados de ADN-proteína e interacção proteinprotein para facilitar a identificação das vias metabólicas regulados pelo factor de transcrição de interesse.
Comentários não encontrado