proTRAC

PROTRAC é uma ferramenta única e acessível para probabilística detecção de cluster piRNA, visualização e análise. PROTRAC apresenta maior sensibilidade e seletividade em relação aos métodos até agora utilizados de detecção de cluster. A sequência de significado da sequência observada lido bater densidade, viés vertente, quantidade correspondente de loci mapeados para raramente lê, a quantidade de loci com T na posição 1 ou A na posição 10 e a quantidade de loci dentro da gama de comprimentos de piRNA típico (26- 32nt) são tidos em conta. As características observadas dos candidatos cluster são avaliados à luz do conjunto de dados dada e estão sujeitas a um sistema de pontuação probabilística.