MISO (mistura das isoformas) é uma estrutura probabilística escrita em Python que quantifica o nível de expressão & nbsp; de genes provenientes de splicing alternativo de dados de RNA-Seq, e identifica isoformas reguladas diferencialmente ou exões entre amostras.
Ao modelar o processo generativo pelo que se lê são produzidos a partir isoformas no RNA-Seq, o modelo MISO usa inferência bayesiana para calcular a probabilidade de que uma leitura originou de uma isoforma particular.
MISO usa a atribuição inferido de lê para isoformas para quantificar as abundâncias do conjunto subjacente de isoformas de mRNA alternativas. Os intervalos de confiança mais de estimativas podem ser obtidos, que quantificam a confiabilidade das estimativas.
Por favor, consulte o manual para http://genes.mit.edu/burgelab/miso/docs/ MISO e documentação
Requisitos :.
- Python
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