Kaks Calculator é um pacote de software que calcula as taxas de substituição nonsynonymous e sinônimo através da seleção de modelo e modelo de média. Desde métodos existentes para essa estimativa adotar seus modelos específicos de mutação que consideram diferentes características evolutivas, levando a diversas estimativas, kaks Calculadora implementa um conjunto de modelos candidatos num quadro de máxima verossimilhança e adota o critério de informação de Akaike para medir a aptidão entre modelos e dados, com o objetivo para incluir tantos recursos conforme necessário para capturar com precisão as informações evolutiva em sequências de proteínas de codificação. Além disso, vários métodos existentes para o cálculo Ka e Ks também são incorporadas a este software.
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