iNA

Ina (Analyzer Noise Intrínseca) é um software gráfico de código aberto escrito em Qt e concebido para funcionar como um utilitário analítico, quantificando flutuações nas redes bioquímicas.
Analisador de ruído intrínseco é capaz de computar aproximação linear ruído (LNA), bem como aproximações mais precisas automaticamente obtida a partir do sistema de expansão tamanho de um ficheiro SBML (Biologia de Sistemas Markup Language).
Sendo escrito em Qt, Ina é uma ferramenta multi-plataforma que suporta Linux, Mac OS & nbsp; sistemas operacionais X e Windows

O que é novo nesta versão:.

• scans de parâmetros (desde 0,4) - Obter medidas estatísticas, tais como coeficiente de variação, Fano fatores, bem como médias e variâncias de concentrações da aproximação ruído linear, correções de ordem superior ou média em tempo estocástico simulações.
• quantidades conservadas -. Analisar as leis do seu modelo de conservação em Ina
• editor Plot - Um novo editor gráfico para visualização de alta qualidade permite personalizar e editar todas as parcelas existentes em Ina. Você pode adicionar ou excluir qualquer gráfico a partir de dados de simulação sem a hazzle de replotting.
• apoio OpenMP para o MacOS X - fazer pleno uso de seus recursos e realizar análises e simulações em múltiplos núcleos de forma automática e em paralelo
.

O que é novo na versão 0.4.1:

• parâmetro SSA varredura
• Mais eficiente SSE varredura parâmetro usando intérprete bytecode ou LLVM
• Drag & drop modelos em painel lateral para a importação
• Ativação Plots personalizado para Windows usando o interpretador bytecode
• Permitir mensagens de log para ser salvo em arquivo ou copiado para o clipe bordo
• filtro Nível de mensagens de log
• Lower limiar para autocompletar
• Notificação se identificador não pode ser alterado
• A notificação se a expressão não pode ser analisado
• Permitir para mover os parâmetros locais para o escopo global
• Ajustar Makefile para compilação com LLVM 3.2
• Permitir TeX em rótulos de plotagem
• títulos enredo Centro no eixo não a figura
• Fix: Falha de segmentação quando expandindo reacções reversíveis
• Fix: expressões exportar usando exp () para SBML
• Fix: análise estado de equilíbrio, concentração zero declarada erradamente instável
• Fix: Cor de rótulos de escala eixo
• Fix: Tamanho da fonte em SVG exportação
• Correção: Remover Fano enredo para o parâmetro de volume de digitalização
• CORRECÇÃO: Vários vazamentos de memória
• Fix: manipulação parser errada de operadores associativos
• Fix: A serialização de grande inteiros abs () & # x3e; 1E6
• Fix: Atualização cinética vista lei / chem eq após atualização reação
• Fix: O tratamento de exceções para o volume 0
• Fix: Permitir símbolos TeX desconhecidos em Plot personalizado
• Fix: Exceção de análise o modelo vazio
• Fix: view reação Update se nome de parâmetro ou identificador foi alterado
• Fix: Disposição de TeX sobrescrito
• Fix: Chamadas de função na expressão escritor
• Fix: Alinhamento Vertical da linha e etiqueta em lendas enredo
• CORRECÇÃO: Unidades de parâmetros de reação
• CORRECÇÃO: Customized faltando Plot lendas enredo
• Fix: Movimentação de nomes de arquivos unicode
• Fix: Exportação de unidades de substâncias a SBML
• Fix: A análise de unidades de substância em SBMLsh
• Fix:. Fundo de expressões prestados
• Fix: Ajustado cursor do mouse Hoovering para unidades do modelo para indicar que eles são editáveis. Também adicionar uma dica.
• Fix: Título da janela no editor SBML-SH
• Fix: Cores em tabelas de estado estacionário (sendo não-selecionável)

Requisitos :

• CMake
• Qt