Gephi

Gephi é uma ferramenta para importar, explorar, manipular, analisar, filtrar, clusterize, espacializar e exportação de grandes gráficos e redes

O que é novo nesta versão:.

• Este foco lançamento em novos recursos para usuários e desenvolvedores, bem como a nova licença desbloqueia as oportunidades de negócio. Os módulos no ranking e Visualização foram completamente reescrito de uma forma modular e pode ser agora alargado com plug-ins! Pré-visualização pode agora ser estendido de muitas maneiras, por exemplo, formas de grupo ou agregação borda. Além disso, o progresso contínuo foram feitas com o apoio da rede dinâmica e nós liberamos hoje o último grande parte: estatísticas ao longo do tempo, disponível a partir do módulo de Estatísticas quando a rede é dinâmica. Graças a usuários que relataram erros, é a única maneira de corrigi-los.

O que é novo na versão 0.7 Beta:

• Novos recursos:
• Laboratório de Novos Dados (Manipular colunas, Procurar / Substituir, mesclar, Sparklines ...)
• visualização da rede Longitudinal, topologia mudando ao longo do tempo, bem como atributos
• Timeline agora está funcionando corretamente, aparece automaticamente quando o gráfico é dinâmico, único botão, para permitir filtragem
• Mostrar / Ocultar rótulos de filtros - pode ser reposto pela 'Reset Visible "ação (à esquerda da janela de gráfico)
• Monitor de peso ponta como etiquetas em visualização
• New StAX GEXF importador e exportador, com hierarquia e suporte dinâmico
• Nova Lista / Arrays tipos de atributos. Só podem ser importados de GEXF por agora.
• NÃO Operator (Filtros)
• Operador MASK (Filtros) - manter as bordas de acordo com origem / destino / ambos / qualquer - pode facilmente obter os vizinhos de um conjunto de nós
• Nivelar Filter - Achate um gráfico hierárquico à vista visível, transformar em meta-bordas bordas normais
• O novo Filtro de componentes Gigante
• importação Período de tempo, nova opção em 'Import Report' para importar arquivos estáticos sucessivas e se transformar em dinâmico
• Zoom deslizante em opções de visualização
• opção "Importar nós ausentes 'no relatório de importação - escolher se deseja criá-los ou não
• Definir tamanho para a ação 'Reset Size', clicando com o botão direito do mouse sobre o botão de reset tamanho
• Get coluna grau de gráficos sem direção
• Estatísticas Relatórios Agora salvo em projetos Gephi
• opção Novo Peso Rescale 'em Preview, para forçar peso parece o mesmo que Overview
• Nova opção "Original" para bordas de cor em Preview, mantém a cor da borda original, vindo de partição por exemplo
• Copie e mova os nós de espaço de trabalho novo ou existente
• Novas predefinições de visualização
• A localização é agora possível, e linguagem mudança de Gephi
• Quando arestas paralelas são encontrados durante a importação, que agora aumenta o peso da borda por padrão
• Opção de filtro Ego para incluir o nó pai ou não
• Meta-arestas têm agora um controle deslizante escala separada em configurações de visualização, alterar a espessura são comparados com bordas normais
• Ranking e Partição lista de atributos agora são classificados
• Ranking agora atualiza-se com gráficos filtrados. Clicando em Aplicar irá atualizar limites ea transformação (cor, tamanho) está correto
• Agora é possível arrastar uma consulta sub filtro para se tornar uma consulta principal
• Com atributos dinâmicos, Ranking, Partition, Visualização e Filtros usará a gama Timeline atual para encontrar valores
• peso de Borda pode ser dinâmico, tipo DYNAMIC_FLOAT. Layout de Força Atlas usará a faixa Timeline atual
• Os filtros são atualizados quando o gráfico é modificado, o filtro atual é reexecutado
• A localização é agora possível, francês e espanhol estarão disponíveis em breve
• Bugfixes:
• borda errada removido do filtro de Borda Peso (bug 603469)
• Filtragem com cascos convexos exibido (bug 541819)
• NullPointerException ao filtrar gráficos sem direção (bug 571153)
• NullPointerException sobre a importação de gráfico dinâmico (bug 581872)
• GTK + problema deslizante (bug 529913)
• Meta-bordas não são exibidas (bug 584283)
• Preview não está exibindo meta-arestas (bug 584289)
• Erros com Yifan Hu MultiLevel layout em um gráfico filtrada (bug 594643)
• Modo de Nó Tamanho e filtro Paramaters não salvar no projeto (bug 596430)
• Vazamento de memória em GEXF / GraphML Analisador (bug 596872)
• incorreta peso borda mútuo em Preview (bug 610469)
• O progresso não é mostrado ao abrir / salvar o projeto (bug 594644)
• Não é possível cancelar uma abertura de projeto (bug 616415)
• Lentidão em escolher uma entrada de partição (bug 519549)
• Configuração EdgeList banco de dados não é salvo (bug 571263)
• 'start' e atributos 'finais' estão faltando ao exportar GEXF dinâmico (bug 521848)
• Partition & quot; All Blacks & quot; O recurso randomizes cores (bug 601066)
• gráfico filtrada não exportado com & quot; Select & quot; pressionado (bug 573685)
• Configurações de partição em filtro não salvos em espaços de trabalho de comutação (bug 616052)
• Abertura arquivados arquivos ZIP é quebrada (bug 578876)
• Exceção em clicando em 'Hierarquia' durante a execução de layout multinível (bug 631663)

Dados
• GraphML importador não importar rótulos de nó (bug 581629)
• Não é possível salvar / salva como quando se abre uma Gephi pela DoubleClick um gráfico no Windows (bug 583397)
• ForceAtlas e Fruchterman Reingold não layouting com os meta-arestas (bug 584286)
• Vazamento de memória no Gráfico Distância (bug 587450)
• NullPointerException ao executar o & quot; Eigenvector Centralidade & quot; Estatística (bug 589731)
• ao alternar entre espaços de trabalho, enquanto um layout está sendo executado NullPointerException (bug 597458)
• Não é possível arrastar uma sub-consulta de filtro para tornar-se uma consulta de raiz (bug 626495)
• parâmetros Ranking reinicializado em cada novo ranking (bug 594231)
• Ranking não atualizados quando gráfico filtrada (bug 632459)
• nó invisível (muito pequeno), quando criado com o lápis nó (bug 574807)
• Erro ao abrir Plugin Center (bug 616829)
• Não é possível selecionar PostgreSQL motorista em configurações de importação de banco de dados (bug 595223)
• Não é possível mostrar o peso borda como texto (bug 603134)
• Import transformar a Indireta não mesclar peso (bug 603478)
• clique com o botão direito no espaço de trabalho após a exclusão de um nó joga & quot; nó não pode ser nulo & quot; (Bug 605947)
• In / Out métrica grau não funciona com gráficos sem direção (bug 606305)
• NullPointerException ao selecionar & quot; - Escolha um Layout & quot; na caixa de combinação Layout (bug 606964)
• Workspace Seleção não conseguiu atualizar após o fechamento do espaço de trabalho (bug 616814)
• inversão de cores seleção Visualization entre 'fora' e 'tanto' cor (bug 618726)
• 'Format' não reconhecido na importação DL (bug 619069)
• janela Editar não escondida em abas (bug 552494)
• gráfico dinâmico não reconhecida se os nós eternos (bug 555637)
• FileNotFoundException durante salvamento de arquivo PDF (bug 572876)
• & quot; do nó deve estar no gráfico & quot; erro ao importar um gráfico hierárquico com altura superior a 1 (bug 577180)
• escala Auto vira o gráfico (bug 577843)
• Impossível cancelar o cálculo Estatística Média Tamanho do caminho (bug 590226)
• relação de Visualização não disponível na primeira vez (bug 594176)
• Seleção padrão de nós no Laboratório Dados necessários (bug 594515)
• & quot; CommandLineParsing nulo & quot; mensagem de erro quando ao abrir arquivo de linha de comando ou do desktop (bug 594630)
• Não é possível importar o mesmo arquivo duas vezes na janela de boas-vindas (bug 598157)

Problema exportação
• arquivo CSV (bug 598767)
• Não é possível fechar projecto ao gerar um gráfico (bug 631341)
• limitação de tamanho Visualization (bug 602470)
• rótulo duplicado na janela de filtro (bug 604003)
• As partições não atualizar ao abrir projeto não de Overview (bug 612902)
• coordenada Z não exportado em GraphML (bug 614606)
• posições de nó mal ao configurar o X ou Y a zero (bug 615844)
• consulta de filtro selecionado não corretamente atualizado em UI (bug 626483)
• Exportar para o fundo pdf é sempre branco (bug 583386)
• arquivos SVG que não figuram no diálogo Export (bug 626394)
• tamanho do nó errado quando Ranking tem mesmo min eo tamanho máximo (bug 631689)
• Leia posições a partir de arquivos de ponto (bug 594793)
• Ranking e parâmetros partição não lista ordenada (bug 594520)
• Nó Grau não em Rótulo Configurações de texto (bug 598170)
• pasta errada selecionada no Painel de exportação quando se muda o tipo de arquivo (bug 620337)
• Gerar um gráfico em um grafo não direcionado carregado anteriormente (bug 624671)
• errada espessura do traçado quando SVG importado no Illustrator (bug 626378)
• A filtragem não atualizados quando sub-consultas estabelecidas ou removidos (bug 594511)
• Os erros na exportação de PDF quando os rótulos têm o tamanho da fonte zero (bug 626865)
• O texto não exibido em Preview (bug 627567)
• Edges cor nativa não são exibidos na pré-visualização (bug 586237)
• escala de peso Edge é diferente entre Graph e Preview (bug 569329)
• bordas negativos não prestados em Preview (bug 628223)
• Arestas de peso não se fundiu com arestas paralelas (bug 648600)
• filtro Partition filtra automaticamente valor nulo (bug 648600)
• Exceção no arquivo de projeto de abertura (bug 648617)
• Filtro Ego não inclui o próprio nó (bug 649908)
• PDF Exportar somente com fonte padrão (bug 651273)
• Nós não desmarcada depois de desligar Seleção no Painel Filtro (bug 649920)
• API:
• Adicionar um método flatten () para HierarchicalGraph para achatar o gráfico hierárquico e transformar bordas meta em bordas regulares.
• Adicionar destruir (filtro Filter) em FilterBuilder para receber notificação quando uma consulta de filtro é removido e limpo-up.
• Adicionar MetaEdgeBuilder no Gráfico SPI para permitir construtores personalizados. Adicionar GraphSettings.setMetaEdgeBuilder () nas configurações do modelo gráfico.
• Modificar StatisticsModel para armazenar relatórios diretamente em vez de instância Statistics. Como consequência, o modelo tem agora um método getResult () IU que podem usar GetReport () e. As estatísticas actualmente em execução agora pode ser ganha com um método novo getRunning ().
• Simplificar e melhorar o gerenciamento de eventos de atributos. Os ouvintes de eventos agora inscrever-se directamente a partir do AttributeModel em vez de AttributeTable e receberá eventos para todas as tabelas. Refatoração da classe AttributeEvent com AttributeTable como fonte e um novo objeto AttributeEventData como dados. Um novo set_value foi implementado para obter eventos quando valores de atributos são definidos.
• Alterações em AttributeRowFactory, o método newNodeRow () agora toma o proprietário do objecto NODEDATA como um parâmetro. Da mesma forma para newEdgeRow () e newRowForTable ().
• Adicionar GetEdge (Nó, Nó) em GraphAPI por razões de coerência.
• As alterações nas Processor SPI. O processador tem agora setters em vez de um método de processo () com parâmetros. Como os processadores são criados permanece a mesma. Criação de uma interface ProcessorUI para configuração configurações processadores. A implementação ProcessorUI fornece um painel, que é mostrado quando o relatório de importação está se fechando. O ProcessorUI também permite desativar um processador com algumas condições.
• Adicionar getColor () método em NodeDraft e EdgeDraft.
• Definir o & quot; Overview, & quot; Laboratório de Dados & quot; e & quot; Pré-visualização & quot; como perspectivas. Criar um novo SPI para perspecives e membros de perspectiva. Os membros são simplesmente o TopComponent que pertencem a uma perspectiva. Plugins podem implementar PerspectiveMember para definir o comportamento de abrir e fechar.
• Adicione os tipos de lista / matriz em Atributos API. Todos os tipos nativos tem agora um tipo de lista relacionado, exceto tipos dinâmicos. Os tipos de lista herda AbstractList.
• As mudanças na forma como as ofertas de importação de API com intervalos de tempo e dados dinâmicos. Suporte para atributos dinâmicos foi adicionado com um método novo addAttributeValue () in NodeDraft e EdgeDraft. Para melhorar as possibilidades de limpeza de dados, NodeDraftGetter e EdgeDraftgetter agora retorna um AttributeRow em vez de uma lista de apenas valores de atributos. Finalmente, para lucrar mais recentes melhorias, projetos de elementos retorna diretamente um tipo TimeInterval em vez da lista de fatias. Métodos com 'fatia' foram renomeados para "Interval" por razões de coerência.
• Adicione os tipos de dinâmicas em Atributos API. Tipos de armazenar valores dinâmicos com um intervalo de tempo e de consulta pode ser personalizado com estimadores. Todos os tipos dinâmicos herdam DynamicType
• API Graph melhorias de gestão de eventos. O GraphEvent tem eventos agora precisas, incluindo ADD_NODES, REMOVE_NODES, ADD_EDGES, REMOVE_EDGES e VISIBLE_VIEW. Uma nova interface GraphEventData foi criado para recuperar elementos relacionados com os acontecimentos.
• refatoração API de exportação, inspirada de ImportAPI. Criar uma interface ExporterBuilder para a criação exportador e diferentes exportadores: GraphExporter, VectorExporter, ByteExporter e CharacterExporter que abrange os casos comuns. A maneira exportadores gravar dados foi racionalizada usando um java.io.Writer (texto) ou java.io.OutputStream (byte). O ExportController foi melhorada para suportar todos os casos de uso, incluindo arquivos, escritor e fluxo de exportação.
• Adicionar suporte Spigot à ImportAPI e SPI. Como DatabaseImporter, a interface SpigotImporter é um novo tipo de importadores. Modificações também ser feitas para o ImportController para apoiar importação torneira.
• A refatoração e melhorias na API Importação e SPI. O objetivo refatoração é resolver o problema do solteirão com importadores e permitir que os usuários implementar construtores interface que criar instância importadores. Portanto uma interface ImporterBuilder foi criada e deve ser registrado com a anotaçãoServiceProvider. Os tipos diferentes importadores foram simplificados e deixar mais escolha para as implementações sobre como a entrada é gerenciado. XML e arquivos de texto importadores foi fundida em uma interface FileImporter, trabalhando com o java.io.Reader. Métodos estáticos de serviços públicos, por exemplo, obter documentos a partir Reader pode agora ser encontrado em uma nova classe ImportUtils. O ImportController foi simplificado para importação de arquivos e agora aceita java.io.Reader também. A principal melhoria nesses módulos no suporte de componentes de interface do usuário para os importadores. O objetivo é permitir que os importadores definir uma implementação ImporterUI para gerenciar as configurações desses importadores.
• Melhorias na gestão de identificadores GraphAPI. O sistema está agora armazenamento de identificadores de cordas provenientes de usuários. Novos métodos getters e setters foram criados no Gráfico: Graph.setId (Node, String), Graph.setId (Edge, String), Graph.getNode (String), Graph.getEdge (String). Os NodeData.setId () e EdgeData.setId () métodos foram removidos, a compatibilidade não pode ser mantido. Fábrica também ser alterada para permitir a criar elementos com corda ID diretamente, pois não é mais possível fazer isso a partir NODEDATA.
• As alterações nas AttributesAPI com gerenciamento de eventos. O sistema de pesquisa no AttributeTable foi substituída por um sistema de gestão de eventos mais tradicional, com novas interfaces e AttributeEvent AttributeListener. A implementação expedição também está agora em um segmento separado.
• As mudanças na importação módulos para interfaces de núcleo e de usuário separadas. O ImportController agora está fazendo tarefa de importação única e uma nova ImportControllerUI está exibindo a interface do usuário (Relatório do Painel). A interface ImportControllerUI está localizado no módulo DesktopProject e deve ser usuário importar corretamente arquivo de plug-ins. Os métodos ImportController poderia ser usado a partir do kit de ferramentas.

O que é novo na versão 0.7 Alpha 4:

• A versão alfa 4 acaba de ser lançado, e vir com um conjunto de novas funcionalidades e muitos bufixes. O próximo lançamento deve ser beta e vêm com mais estabilidade e um conjunto fixo de recursos.

O que é novo na versão 0.7 Alpha 3:

• Mais de 25 bugs foram corrigidos nesta versão , e alguns pequenos recursos adicionados. A versão também adiciona a & quot; Gephi 3rd Party & quot; fonte plug-in no centro da Plugins. Catálogo está actualmente a ler a partir de fontes oficiais e 3rd party. Foram adicionados dois novos módulos.

O que é novo na versão 0.7 Alpha 2:

• Novos recursos:
• suporte de peso Melhor borda. Peso não é mais modificado por & quot; Auto-scale & quot; opção sobre Import.
• Melhor nós / bordas contagem. Conta apenas nós visíveis.
• Melhorar as estatísticas / métricas configurações painéis. Adicionar descrição e documentação sobre métricas e suas configurações.

Salvar
• Project / carga foi corrigido. Note-se que a compatibilidade com 0.7alpha1 está quebrado.
• Corrija mecanismo de atualização automática. Mais atualizações estarão disponíveis através de built-in de atualização.
• Bugfixes:
• freeze aplicativo quando importar o arquivo no Linux (bug 519423)
• Janela de layout não pode ser restaurada quando foi desencaixado (bug 519424)
• anner não visível no Mac OS X e Linux (bug 522403)
• Preview não esconde elementos filtrados (bug 522402)
• Projeto de carga / salvar interface de falha (bug 522889)
• rótulo nó vazio provoca mensagem de erro incorreta durante a importação & quot; unkown node id & quot; (Bug 519254)
• Na GDF exportação, remover uma coluna não remove a vírgula (bug 519810)
• Na GDF exportação, o campo Id é mal escapou (bug 519820)
• Atributo mau comportamento filtragem borda (bug 522771)
• Contexto de dados não funciona em Indireta Graph (bug 522886)
• filtro dinâmico exibe 0 nó (bug 523128)
• Opções tag funciona apenas para valores de uma letra (bug 519252)
• Favoritos, propriedades e saída de menu aparece na janela e não pode ser fechado. (Bug 521400)
• melhoradas performances ao ajustar o intervalo com o mouse (bug 521939)
• bug corrigido quando se lida com outros tipos de dados dinâmicos que data (bug 521544)
• bug corrigido com a repartição visual de graduações (bug 521941)
• Usabilidade:
• Nó e botão de alternância de Borda em VizBar têm o mesmo texto dica de ferramenta
• Painel de Relatório (Import) é verticalmente extensível
• Módulos Atualizado:
• DesktopContext
• DesktopBranding
• DesktopHierarchy
• DesktopPartition
• DesktopRanking
• DesktopTools
• VisualizationModule
• DesktopImport
• DesktopLayout
• ProcessorPlugin
• DHNSGraph
• DesktopTimeline
• TimelineAPI
• TimelinePluginUI
• ExportPlugin
• ImportPlugin
• StatisticsPluginUI
• GraphAPI
• ExportPluginUI
• PreviewImpl
• DesktopPreview
• FiltersPlugin
• ImportAPI
• DesktopFilters
• ProjectAPI

O que é novo na versão 0.7 Alpha:

• A versão alpha Gephi 0.7 foi liberado e está disponível para propósito de testes. Como 0.7 é uma reescrita completa, ele vai precisar de alfa e beta versões para congelou recursos e corrigir todos os erros.
• Todos os restantes 0,6 erros serão apagados agora.
• Uma nota adicional sobre o código fonte: Você precisa atualizar Netbeans 6.8 com atualizações de módulos atuais para ser compatível com repositiory atual
.

O que é novo na versão 0.6 Beta 3:

• Bugs relacionados com 0,6 serie foram limpos. Estávamos reorganização para torná-lo claro para 0,7 desenvolvimento.
• O fato é, 0,7 é completamente novo em comparação com 0,6, tão erro não estão ligados e 0,6 desenvolvimento está parado.
• Por isso, a única coisa a fazer é esperar para o 0.7 alpha vindo.
• Não é preciso dizer relatórios erros ainda existe e nós tomamos muito cuidado para não repetir mesmos erros para 0,7.

Requisitos :

• Java 2 Standard Edition Runtime Environment
• OpenGL