GenoSuite é um framework desenvolvido para análise proteogenomic. Estratégia baseada FDRScore é utilizada para integrar os resultados de vários algoritmos de busca. Prokaryotic Ferramenta Proteogenomic (PPT) é desenvolvido como parte do quadro GenoSuite. PPT é para encontrar novas traduções em genomas de procariotas e é dependente de dados de proteômica baseados Espectrometria de Massa e seqüência do genoma relacionadas. As características incluem configurado para 4 algoritmos de código aberto para a realização de banco de dados em busca de identificação de peptídeos e qualquer combinação do algoritmo 4 pode ser escolhido, enumera os peptídeos específicos de pesquisa do genoma (peptídeos romance), partidas espectrais podem ser visualizados para a avaliação da qualidade, enumera as novas proteínas e mudanças nas anotações de proteínas existentes, e um contexto genómico visual dos novos péptidos podem também ser gerados.
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