DiffPDF pode comparar dois arquivos PDF. Ele oferece três modos de comparação: palavras, caracteres e aparência. Por padrão, a comparação é das palavras em cada par de páginas, mas comparando caractere por caractere também é suportado (por exemplo, para as línguas logographic). E há também o apoio para comparar as páginas de aparência (por exemplo, se um diagrama é alterada ou se um parágrafo é reformatado, ou um tipo de letra mudou). Também é possível comparar determinadas páginas ou intervalos de páginas. Por exemplo, se há duas versões de um arquivo PDF, um com páginas 1-12 e outra com páginas 1-13 por causa de uma página extra de ter sido adicionado como página 4, que pode ser comparado ao especificar dois intervalos de páginas, 1 -12 para a primeira e 1-3, 5-13 para a segunda. Isso fará com que as páginas no DiffPDF comparar os pares (1, 1), (2, 2), (3, 3), (4, 5), (5, 6), e assim por diante, para (12, 13). Versão 1.5.0 adicionada a capacidade de salvar um arquivo PDF que mostra as páginas que diferem com as suas diferenças em destaque. Versão 2.0.0 adicionado suporte para exclusão de margem e um melhor manuseamento janela dock. Versão 2.1.0 adicionado suporte para arrastar e soltar, correções de bugs, e traduções francesas e alemãs.
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