ferramenta de linha de comando para comparar vírgula delimitado arquivos de dados utilizando as diferenças relativas a determinar as conformações mais semelhantes. Compsort compara os arquivos de dados usando diferença relativa, calcula uma pontuação de similaridade, classifica as notas em ordem crescente (valores mais baixos representam maior similaridade), salva um número X de baixa pontuação.
Os arquivos de dados produzidos pelo usuário, deve ser por vírgula arquivos de texto delimitado. Cada arquivo representa uma molécula única. Cada linha representa um ficheiro de uma única conformação da molécula. A primeira coluna no ficheiro de dados deve ser um único rótulo para a conformação representada pela linha. O restante das colunas são descritores numéricos, tais como medições de distância de espaço.
As linhas são comparados combinatorialmente entre arquivos. Os rótulos na comparação são concatenados e salvo com a pontuação para o conjunto de linhas. Isto proporciona uma maneira de identificar as conformações que produziram um dado pontuação de semelhança.
Trabalhos futuros incluem:
- acrescentando interface gráfica
- postando papel no meu algoritmo de modelagem 3D pharmacophore
- A versão paralela utilizando MPI
O que é novo nesta versão:
- fixa um par menor avisos do compilador
- adicionado relatórios de tempo de cálculo para conjunto de cálculos combinatórias, além do tempo tipo relatado anteriormente
- aumento do nível de otimização do compilador do binário
Requisitos :
Mac OS X 10.3
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