Bio-Linux

Bio-Linux é um sistema operacional de código aberto baseado no mundo & rsquo; s distribuição gratuita mais popular do Linux, Ubuntu, construído em torno do ambiente de desktop Unity moderno e projetado desde o início para ser usado por bioinformaticians.Distributed como um , dual-arco DVDThe Vivo distro única pode ser baixado do Softoware como single, dual-arco ao vivo imagens ISO de DVD de aproximadamente 3 GB de tamanho, com suporte para 64 bits (x86_64) e 32 bits (i386) arquiteturas de conjunto de instruções. Deve ser implantado em uma unidade flash USB ou disco DVD, a fim de a arrancar a partir do BIOS de um optionsBeing computer.Boot baseado em Ubuntu, possui um gerenciador de inicialização idênticos, projetado para permitir que você a experimentar o sistema operacional sem precisar instalar nada , iniciar diretamente o instalador, testar a RAM para erros, arranque a partir do primeiro disco, bem como para verificar a integridade do meio de arranque (somente se estiver usando uma mídia de DVD) .Modern e ambiente produtivo ambiente de trabalho alimentado por UnityAs mencionado, a distribuição & rsquo ; s padrão e só ambiente de trabalho é a Unidade, que utiliza um layout de painel / dock. Enquanto o painel, que está localizado na parte superior da tela, é perfeito para interagir com os programas em execução, a estação irá ajudá-lo a lançar rapidamente o seu applications.Some favorito dos melhores bioinformática código aberto appsSome das melhores aplicações de bioinformática de código aberto estão incluídos neste sistema operacional baseado no Ubuntu, dentre os quais podemos citar Act, Arb, Cn3D, Cytoscape, Archaeopteryx, Artemis, BTmapqtl, ClustalX, Dendroscope, DDV Sequence Alignment Viewer, Entrez, eQTL, Galaxy, GAP4, GAP5, FastQC, Geneious, GGobi, ISACreator, rei, LRmapqtl, algaroba e Jemboss.Bottom lineSumming up, Bio-Linux é um sistema operacional muito rápido e produtivo baseado na última versão upstream Ubuntu e usar o ambiente desktop GNOME Classic, bem como alguns dos melhores aplicações de bioinformática open source

O que é novo nesta versão:.

• aborda um problema recente com o ambiente de trabalho não para começar no VirtualBox devido a controladores incompatíveis.
• Atualizações de vários pacotes, nomeadamente ferramentas QIIME e Bowtie-Bio.
• Adiciona o pandaseq emparelhado final assembler.
• Adiciona os iniciantes atualizados tutorial específico para Bio-Linux 8.

O que é novo na versão 8.0.2:

• Novo Ubuntu 14.04 sistema base suporta o mais recente hardware e fornece up-to-date software de escritório, multimédia, etc.
• As versões atualizadas dos principais aplicativos de bioinformática como QIIME, Mothur, Jalview, Artemis, BLAST, ferramentas Bowtie-Bio e muitos mais (usuários que não atualizar não terão mais atualizações).
• Up-to-date versões de muitos pacotes de R incluindo ggplot2, DESeq e aparador mais atualizado Bioconductor e milhares mais pacotes disponíveis para instalação direta via C2D4U.
• Prestação de modelos pré-preparados para uso em VMWare / VirtualBox.
• A substituição do NX com X2Go, uma versão mais flexível do sistema-desktop remoto rápido e seguro.
• A inclusão da área de trabalho MATE como uma alternativa leve para Unity.
• A embalagem mais robusta do Galaxy, com suporte para carregamento de ferramentas ferramenta de galpão, procuração Apache, PostgreSQL automatizado set-up, a autenticação de contas locais e uploads de arquivos SFTP.
• Um gatinho livre com cada download!
• ... ok, eu posso ter mentido sobre o gatinho mas temos alguns novos papéis de parede lindos apresentadas pela comunidade de usuários - veja abaixo
.

O que é novo na versão 7.0.3:

• Bio-Linux 7 é caracterizado inteiramente, poderoso , configurável e fácil de manter bioinformática estação de trabalho. Bio-Linux oferece mais de 500 programas de bioinformática em uma base LTS do Ubuntu Linux 12.04. Há um menu gráfico para programas de bioinformática, bem como fácil acesso ao sistema de documentação bioinformática Bio-Linux e dados de exemplo útil para programas de testes.
• Bio-Linux 7 adiciona muitas melhorias em relação às versões anteriores, incluindo o ambiente de análise Galaxy. Há também vários pacotes para lidar com a nova geração de tipos de dados de seqüência.
• Você pode instalar Bio-Linux em sua máquina, ou como o único sistema operacional, ou como parte de uma configuração dual-boot, que permite que você use o seu sistema atual e Bio-Linux no mesmo hardware.
• Bio-Linux também executa ao vivo a partir do DVD ou pendrive USB. Este é executado na memória de sua máquina e não envolve a instalação de qualquer coisa. Este é um grande, sem complicações maneira de experimentar Bio-Linux, demonstrar ou ensinar com ele, ou para trabalhar com quando você está em movimento.
• Bio-Linux é construído em sistemas de código aberto e software, e por isso é livre para instalar e usar.